基本农田栽树当事人可以向由当地政府部门和国土资源部门投诉。
根据相关法律规定规定禁止任何单位和个人占用基本农田发展林果业和挖塘养鱼。但处罚方法并无明确规定，一般以罚款为主。
基本农田是指中国按照一定时期人口和社会经济发展对农产品的需求，依据土地利用总体规划确定的不得占用的耕地。基本农田除了用作耕种之外，不得用作其他的。如果已经种了树可以通过以下的方式处理：
1、当事人出发点是为了增加收入，所以及时的规劝是首要的选择。可以向其讲解有关法律法规，积极鼓励当事人自己恢复耕种；
2、引导当事人种植经济果木，把原来的可移栽果树种植到正确的地方，形成规模效应，实现收入增加；
3、对于拒绝恢复农田原貌、不听劝导的当事人，可以依法保障基本农田。法律依据：《中华人民共和国土地管理法》
第三十七条非农业建设必须节约使用土地，可以利用荒地的，不得占用耕地；可以利用劣地的，不得占用好地。
禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等。
禁止占用永久基本农田发展林果业和挖塘养鱼。
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1、基本农田不可以种树。基本农田的是结合农产品的需求而划定的，其目的是为了保障粮食等农产品的足量需求，保障国家粮食安全。如果基本农田种树栽树，就会在很多年的时间内占用耕地，不能种植粮食等农作物，并且树木根系比较发达，会对耕地造成较长时间的破坏，对耕地的伤害也比较大。
2、法律依据：《中华人民共和国土地管理法》第三十七条
非农业建设必须节约使用土地，可以利用荒地的，不得占用耕地；可以利用劣地的，不得占用好地。
禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等。
禁止占用永久基本农田发展林果业和挖塘养鱼。
第三十八条
禁止任何单位和个人闲置、荒芜耕地。已经办理审批手续的非农业建设占用耕地，一年内不用而又可以耕种并收获的，应当由原耕种该幅耕地的集体或者个人恢复耕种，也可以由用地单位组织耕种；一年以上未动工建设的，应当按照省、自治区、直辖市的规定缴纳闲置费；连续二年未使用的，经原批准机关批准，由县级以上人民政府无偿收回用地单位的土地使用权；该幅土地原为农民集体所有的，应当交由原农村集体经济组织恢复耕种。
在城市规划区范围内，以出让方式取得土地使用权进行房地产开发的闲置土地，依照《中华人民共和国城市房地产管理法》的有关规定办理。
二、基本农田和耕地的区别是什么
基本农田和耕地的区别如下：
1、概念不同，耕地是用于种植小麦、水稻、玉米等农作物，并经常进行耕地的土地，而基本农田是指根据一定时期人口和国民经济对产品的需要以及对建设用地预测、规划的长期不得占用耕地；
2、属性不同，耕地包含了基本农田，不是所以的耕地都是基本农田；
3、性质不同，基本农田是重点保护的耕地种类，耕地不属于重点保护种类。